10.13 Recursos de Stan y paquetes con R

  • Stan Manual. Manual de referencia oficial del lenguaje Stan.

  • Stan User’s Guide. Ejemplos de modelos y técnicas de programación con Stan.

  • Flujo de trabajo Bayesiano de Michael Betancourt. Introduce, con un ejemplo, el flujo de trabajo para construir y evaluar modelos en inferencia bayesiana.

  • El paquete rstanarm, Gabry and Goodrich (2019), facilita el uso de Stan desde R, cuenta con funciones para llevar a cabo estimación Bayesiana sin necesidad de escribir código en el lenguaje de Stan, de acuerdo a los autores el objetivo del paquete es que la estimación bayesiana sea rutina para los modelos de regresión más comunes.

  • El paquete bayesplot, Gabry and Mahr (2019), cuenta con funciones para graficar estimaciones de los parámetros, realizar diagnósticos visuales de las cadenas (convergencia), y analizar el ajuste del modelo (graficando de la predictiva posterior).

  • El paquete shinystan, Gabry (2018), contiene resumenes gráficos y numéricos de parámetros de un modelo y de diagnósticos de convergencia.

Referencias

Gabry, Jonah. 2018. Shinystan: Interactive Visual and Numerical Diagnostics and Posterior Analysis for Bayesian Models. https://CRAN.R-project.org/package=shinystan.

Gabry, Jonah, and Ben Goodrich. 2019. Rstanarm: Bayesian Applied Regression Modeling via Stan. https://CRAN.R-project.org/package=rstanarm.

Gabry, Jonah, and Tristan Mahr. 2019. Bayesplot: Plotting for Bayesian Models. https://CRAN.R-project.org/package=bayesplot.